معرفی آنزیم Poly(A) Polymerase و کاربرد کیت بومیسازیشده شرکت راتین ژن
آنزیم Poly(A) Polymerase نقش حیاتی در فرآیند پلیآدنیلاسیون RNA ایفا میکند. این آنزیم با استفاده از ATP، زنجیرهای از نوکلئوتیدهای آدنین (A) را به انتهای 3′ RNA اضافه مینماید؛ فرآیندی که برای پایداری، ترجمه مؤثر و تنظیم microRNAها ضروری است.
شرکت راتین ژن برای نخستینبار در کشور موفق به تولید کیت اختصاصی این آنزیم با کارایی و دوام بالا شده است. در این مطلب، با نحوه استفاده از این کیت، بررسی بیان microRNA، روشهای غیرفعالسازی آنزیم، نکات کلیدی و راهکارهایی برای رفع خطاهای احتمالی آشنا خواهید شد.
موارد کاربرد کیت Poly(A) Polymerase
تحلیل بیان microRNA
افزودن زنجیره A به انتهای RNA جهت اتصال پرایمر در سنتز cDNA
افزایش پایداری RNAها برای استفاده در آنالیزهای مولکولی
ساخت کتابخانههای cDNA
ارتقای فرآیند توالییابی و کلونسازی RNA
پژوهشهای ژنتیکی و مولکولی
بررسی مسیرهای تنظیمی وابسته به mRNA و microRNA
کاربردهای درمانی و پزشکی
دستکاری RNA برای استفاده در درمانهای هدفمند
مراحل استفاده از کیت
مواد مورد نیاز:
RNA با کیفیت بالا
آنزیم Poly(A) Polymerase
بافر واکنش
ATP (سوبسترا)
دستورالعمل انجام آزمایش:
آمادهسازی RNA:
RNA را استخراج و با دستگاه نانودراپ خلوص آن را بررسی نمایید.تهیه مخلوط واکنش:
ترکیبات زیر را در میکروتیوب RNase-Free ترکیب کنید:0.5 تا 15 میکروگرم RNA
1 میکرولیتر آنزیم
2 میکرولیتر بافر (10x)
2 میکرولیتر ATP (10 میلیمولار)
RNase-Free Water به میزان لازم برای تکمیل حجم نهایی
انکوباسیون:
مخلوط را در دمای 37 درجه سانتیگراد به مدت 30 تا 60 دقیقه انکوبه نمایید.پایان واکنش و حذف آنزیم:
غیرفعالسازی حرارتی: حرارت دادن در 65 تا 70 درجه به مدت 10 تا 15 دقیقه(به علت تخریب RNA، توصیه نمیشود)
غیرفعالسازی شیمیایی: افزودن EDTA تا غلظت نهایی 10 میلیمولار
تخلیص RNA:
از روشهای معمولی مانند استخراج با کیتهای RNA یا فنل/کلروفرم (TRIzol) استفاده کنید.
بررسی بیان microRNA با استفاده از کیت
اتصال دم Poly(A) به microRNA
سنتز cDNA با پرایمر اختصاصی حاوی توالی T
اجرای qPCR برای بررسی دقیق بیان ژن
خطاهای متداول و راهکارهای پیشنهادی (Troubleshooting)
مشکل رایج | علت احتمالی | راهحل پیشنهادی |
---|---|---|
عدم افزودن Poly(A) | RNA بیکیفیت | استفاده از روش استخراج بهینه و بررسی خلوص |
کاهش فعالیت آنزیم | دفریز و انجماد مکرر آنزیم یا ATP | تقسیم ATP و آنزیم به الیکوتهای کوچک |
عدم تکثیر در qPCR | طراحی نادرست پرایمر | استفاده از پرایمرهای بهینه و اختصاصی |
تخریب RNA | آلودگی به RNase | استفاده از ابزار استریل و محیط RNase-Free |
نکات حیاتی در استفاده از کیت
RNA و نمونههای polyadenylated را در دمای 80- درجه سانتیگراد نگهداری کنید.
تنها از آب RNase-Free استفاده نمایید. برای تهیه آن، DEPC را به نسبت 1:1000 به آب اضافه کرده، مخلوط را 2 الی 12 ساعت در دمای 37 درجه نگه داشته و سپس اتوکلاو نمایید.
جمعبندی
کیت Poly(A) Polymerase شرکت راتین ژن، ابزاری پیشرفته برای تحقیقات مولکولی و بررسی دقیق microRNA است. با بهرهگیری از این محصول ایرانی و رعایت اصول عملکرد صحیح، میتوان به دادههای مطمئن و نتایج علمی ارزشمندی در مطالعات RNA دست یافت.
نظرات کاربران